Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANK1Q8TE04 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANK1Q8TE04 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms