Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELQQ8TDG4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELQQ8TDG4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms