Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX29P2Q8IUI4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms