Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLNKQ7Z7G1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms