Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms