Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms