Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC129Q6ZRS4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms