Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTE2Q6XPS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTE2Q6XPS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms