Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms