Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMBR1LQ6UX01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBR1LQ6UX01 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms