Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A47Q6Q0C1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms