Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NANOGP8Q6NSW7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms