Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms