Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR25Q64LD2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms