Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms