Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLEC12Q5KU26 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms