Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFKFB4Q16877 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms