Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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