Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RABEP1Q15276 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RABEP1Q15276 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RABEP1Q15276 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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