Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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