Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFR3AQ14156 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms