Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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CNGB1Q14028 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB1Q14028 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
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