Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CKAP5Q14008 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CKAP5Q14008 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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