Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMB3Q13751 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms