Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms