Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBB3Q13509 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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