Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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