Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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