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| FOXE3 | Q13461 | AL772307.1-201 | ENST00000639363 | 1066 nt | TSL 2 BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RSPO4-201 | ENST00000217260 | 2707 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LANCL3-201 | ENST00000378619 | 3063 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM7-205 | ENST00000422067 | 1954 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | NDRG2-227 | ENST00000554143 | 1980 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PMEPA1-202 | ENST00000341744 | 4845 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CDK18-217 | ENST00000506784 | 2143 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC006333.2-201 | ENST00000607957 | 2099 nt | BASIC | 14.5 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ANKS3-201 | ENST00000304283 | 2662 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.49 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | QSOX2-201 | ENST00000358701 | 4530 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.49 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ATP6V1G2-205 | ENST00000303892 | 1588 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.49 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TNPO2-203 | ENST00000450764 | 4993 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.49 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | NOMO2-201 | ENST00000330537 | 4352 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.49 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PRTN3-202 | ENST00000544537 | 1036 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MIR3917-201 | ENST00000580971 | 93 nt | BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PDE9A-206 | ENST00000380328 | 1875 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | WWC1-201 | ENST00000265293 | 7130 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | GRK6-201 | ENST00000355472 | 2939 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZBTB48-202 | ENST00000377674 | 2293 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.48 | □□□□□ -0.09 | | |
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