Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIGQ13278 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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