Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NME3Q13232 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NME3Q13232 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NME3Q13232 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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