Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ERCC8Q13216 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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