Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM32Q13049 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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TRIM32Q13049 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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