Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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