Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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