Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TWF1Q12792 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms