Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms