Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms