Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms