Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCL20P78556 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCL20P78556 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCL20P78556 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCL20P78556 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCL20P78556 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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