Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX3P78415 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX3P78415 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms