Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA52P62987 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA52P62987 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA52P62987 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms