Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms