Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms