Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms