Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AQP4P55087 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms