Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms