Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms