Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms