Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms