Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
THBS4P35443 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms